Hi ha dos tipus de microscopis de fluorescència pel que fa al seu camí òptic
1. Microscopi de fluorescència de transmissió: la font de llum d'excitació es fa passar a través del material de la mostra a través d'una lent de condensador per excitar la fluorescència. S'utilitza habitualment un col·lector de camp fosc i també es pot utilitzar un col·lector ordinari per ajustar el mirall de manera que la llum d'excitació es redirigeixi i es passi cap a la mostra. Aquest és un microscopi fluorescent antic. L'avantatge és que la fluorescència és forta amb un augment baix, però el desavantatge és que la fluorescència disminueix amb l'augment de la magnificació. Per tant, és millor observar materials de mostra més grans.
2. El microscopi epifluorescència és un nou tipus de microscopi de fluorescència desenvolupat en els temps moderns. La diferència és que la llum d'excitació cau des de la lent de l'objectiu fins a la superfície de la mostra, és a dir, s'utilitza la mateixa lent objectiu com a condensador d'il·luminació i la lent objectiu per recollir la fluorescència. Cal afegir un divisor de feix dicroic al camí de la llum, que es troba a 45 graus de distància de l'urani lleuger. La llum d'excitació es reflecteix a la lent de l'objectiu i es recull a la mostra. La fluorescència generada per la mostra i la llum d'excitació reflectida per la superfície de la lent de la lent de l'objectiu i la superfície del vidre de la coberta entren a la lent de l'objectiu alhora i tornen al divisor de feix de dos colors per separar la llum d'excitació de la fluorescència. , la llum d'excitació residual s'absorbeix mitjançant filtres de bloqueig. Com canviar a una combinació de diferents filtres d'excitació / divisor de feix de dos colors / filtre de bloqueig, pot satisfer les necessitats de diferents productes de reacció fluorescent. L'avantatge d'aquest tipus de microscopi de fluorescència és que la il·luminació del camp de visió és uniforme, la imatge és clara i com més gran sigui l'augment, més forta serà la fluorescència.
