1. Diferents fonts d'il·luminació
La font d'il·luminació utilitzada al microscopi és el flux d'electrons emès pel canó d'electrons, i la font d'il·luminació del microscopi òptic és la llum visible (llum solar o llum). Com que la longitud d'ona del subflux és molt més curta que la longitud d'ona de l'ona de llum, l'ampliació i la resolució del microscopi electrònic són significativament superiors a les del mirall de llum. .
2. Diferents lents
La lent objectiu que augmenta al microscopi electrònic és una lent electromagnètica (una bobina electromagnètica en forma d'anell que pot generar un camp magnètic al centre), i la lent objectiu d'un microscopi òptic és una lent òptica feta de vidre. Hi ha tres grups de lents electromagnètiques als microscopis electrònics, que són equivalents a les funcions de l'objectiu del condensador i l'ocular dels microscopis òptics.
3. Diferents principis d'imatge
Al microscopi electrònic, el feix d'electrons que actua sobre la mostra que s'ha d'inspeccionar s'amplia amb una lent electromagnètica i després colpeja una pantalla fluorescent per a la imatge o actua sobre una pel·lícula fotosensible per a la imatge. El mecanisme de la diferència de densitat d'electrons és que quan el feix d'electrons actua sobre la mostra que es vol provar, els electrons incidents xoquen amb els àtoms de la substància per generar dispersió, i diferents parts de la mostra tenen diferents graus de dispersió per als electrons, de manera que la imatge electrònica de la mostra es presenta en tons. La imatge objecte de la mostra al microscopi òptic es presenta amb una diferència de brillantor, que és causada per la diferència en la quantitat de llum absorbida per les diferents estructures de la mostra.
4. Resolució
A causa de la interferència i la difracció de la llum, la resolució dels microscopis òptics només es pot limitar a 02-05um. Com que els microscopis electrònics utilitzen feixos d'electrons com a fonts de llum, la taxa de fallada pot arribar entre 1 i 3 nm. Per tant, l'observació de teixits dels microscopis òptics pertany a l'anàlisi a nivell de micres, i l'observació de teixits dels microscopis electrònics pertany a l'anàlisi de nivell nano.
5. Profunditat de camp
En general, la profunditat de camp d'un microscopi òptic està entre 2-3um, de manera que la suavitat de la superfície de la mostra és extremadament exigent, de manera que el procés de preparació de la mostra és relativament complicat. L'esperit de SEM pot arribar a uns quants metres, de manera que no hi ha cap requisit per a la suavitat de la geometria de la superfície de la mostra, la preparació de la mostra és relativament senzilla i algunes geometries de mostra no requereixen preparació de la mostra. Els microscopis estèreo tenen una profunditat de camp relativament gran, però la seva resolució és molt baixa.
6. S'utilitzen diferents mètodes de preparació de mostres
El procediment de preparació de mostres de teixit i cèl·lules utilitzades per a l'observació submicroscòpica és complex, amb una dificultat tècnica i un cost elevats. Es requereixen reactius i operacions especials en els passos de presa de mostres, fixació, deshidratació i incrustació. Finalment, els blocs de teixit incrustats s'han de posar en un ultramicròtom per tallar-los en exemplars ultrafins amb un gruix de 50 ~ 100 nm. Les mostres observades per microscòpia de llum es col·loquen generalment en portaobjectes de vidre, com ara mostres de talls de teixit normals, mostres de frotis cel·lular, mostres de teixit premsat i mostres de gota cel·lular.
7. Ampliació
L'augment efectiu del microscopi òptic és 1000X. L'augment efectiu d'un bon microscopi elèctric pot arribar a 1000.000X.






